Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms