Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms