Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn2aQ99KJ0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms