Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms