Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms