Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cdk9Q99J95 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cdk9Q99J95 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cdk9Q99J95 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cdk9Q99J95 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdk9Q99J95 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms