Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms