Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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