Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms