Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nrif1Q923B3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nrif1Q923B3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms