Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx15Q91WE1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Snx15Q91WE1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms