Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms