Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hecw1Q8K4P8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hecw1Q8K4P8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms