Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms