Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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