Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Depp1Q8K2F3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms