Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FgbQ8K0E8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FgbQ8K0E8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FgbQ8K0E8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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