Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms