Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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