Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx30Q8CE50 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx30Q8CE50 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms