Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc38Q8CDN8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc38Q8CDN8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc38Q8CDN8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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