Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrebrfQ8CDG5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrebrfQ8CDG5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms