Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vwa8Q8CC88 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vwa8Q8CC88 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vwa8Q8CC88 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vwa8Q8CC88 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vwa8Q8CC88 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vwa8Q8CC88 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vwa8Q8CC88 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms