Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slfn5Q8CBA2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms