Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CntrobQ8CB62 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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