Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms