Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gpcpd1Q8C0L9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms