Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Snx16Q8C080 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Snx16Q8C080 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Snx16Q8C080 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms