Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube3dQ8BX13 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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