Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp5Q8BX09 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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