Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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