Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms