Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fbxo38Q8BMI0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Fbxo38Q8BMI0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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