Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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ChfrQ810L3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ChfrQ810L3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ChfrQ810L3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ChfrQ810L3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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