Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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