Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ntf4Q80VU4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ntf4Q80VU4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ntf4Q80VU4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ntf4Q80VU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ntf4Q80VU4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms