Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms