Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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