Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms