Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms