Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LcorQ6ZPI3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms