Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssx9Q6XAS3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms