Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtifQ6PEE2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtifQ6PEE2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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