Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms