Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms