Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm2bQ6P1G2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm2bQ6P1G2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms