Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms