Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Krt40Q6IFX3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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