Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms