Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms